Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CROTQ9UKG9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CROTQ9UKG9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms