Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL4Q9UJQ4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms