Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSRAQ9UJ68 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSRAQ9UJ68 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms