Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRDQ9UH36 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRDQ9UH36 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms