Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGXB4Q9UGU5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms