Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5BQ9UGL1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms