Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R1BQ9UD71 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R1BQ9UD71 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms