Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms