Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNAL1Q9UBT7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms