Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS29Q9UBQ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS29Q9UBQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS29Q9UBQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS29Q9UBQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS29Q9UBQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS29Q9UBQ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VPS29Q9UBQ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VPS29Q9UBQ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VPS29Q9UBQ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VPS29Q9UBQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS29Q9UBQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.1 ms