Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNG4Q9UBN1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms