Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRRQ9UBK8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms