Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFIP11Q9UBB9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFIP11Q9UBB9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms