Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD7Q9P2D1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHD7Q9P2D1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHD7Q9P2D1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms