Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC10Q9NYD6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC10Q9NYD6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC10Q9NYD6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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