Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDND1Q9NY35 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms