Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH5Q9NX47 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH5Q9NX47 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms