Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms