Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL11Q9NVR0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL11Q9NVR0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL11Q9NVR0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL11Q9NVR0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL11Q9NVR0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms