Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZDHHC18Q9NUE0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms