Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms