Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX1Q9NSU2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms