Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF275Q9NSD4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF275Q9NSD4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF275Q9NSD4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms