Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms