Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 KRTCAP2-210ENST00000497317 477 ntTSL 318.02■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 KRTCAP2-209ENST00000492892 430 ntTSL 317.92■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM91-204ENST00000413014 650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.337e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM91-201ENST00000342187 454 ntTSL 516.83■□□□□ 0.287e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 KRTCAP2-208ENST00000491084 598 ntTSL 316.46■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 KRTCAP2-207ENST00000490672 3264 ntTSL 215.78■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 KRTCAP2-202ENST00000461136 271 ntTSL 37□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 BRD2-206ENST00000456339 887 ntTSL 423.66■■□□□ 1.383e-7■■■■□ 25.3
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-218ENST00000515690 858 ntTSL 320.9■□□□□ 0.943e-6■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.743e-6■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 PPP6R2-206ENST00000427222 1811 ntTSL 527.14■■□□□ 1.944e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.824e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 220.03■□□□□ 0.84e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.674e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.614e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.394e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.224e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 MTA1-208ENST00000438610 2144 ntTSL 1 (best)28.04■■■□□ 2.086e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.296e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.266e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.986e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.816e-8■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 MORC3-206ENST00000492336 1290 ntTSL 1 (best)22.12■■□□□ 1.131e-6■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 MORC3-205ENST00000487909 4131 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 25.2
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-206ENST00000502904 2913 ntTSL 214.03□□□□□ -0.162e-28■■■■□ 25.1
DROSHAQ9NRR4 PPP2R2D-207ENST00000616467 2058 ntTSL 1 (best)38.52■■■■□ 3.761e-6■■■■□ 25.1
DROSHAQ9NRR4 PPP2R2D-204ENST00000482010 1792 ntTSL 228.25■■■□□ 2.111e-6■■■■□ 25.1
DROSHAQ9NRR4 TYK2-214ENST00000530220 767 ntTSL 320.74■□□□□ 0.914e-9■■■■□ 25.1
DROSHAQ9NRR4 TYK2-212ENST00000529422 622 ntTSL 516.97■□□□□ 0.314e-9■■■■□ 25.1
DROSHAQ9NRR4 STIP1-208ENST00000540501 880 ntTSL 339.26■■■■□ 3.885e-8■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.335e-8■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.045e-8■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.95e-8■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 STIP1-204ENST00000536973 738 ntTSL 519.78■□□□□ 0.765e-8■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 STIP1-211ENST00000543847 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.145e-8■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 STIP1-209ENST00000540736 399 ntTSL 28.85□□□□□ -0.995e-8■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-208ENST00000430807 733 ntTSL 334.85■■■■□ 3.171e-7■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-211ENST00000434168 862 ntTSL 329.47■■■□□ 2.311e-7■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 233.59■■■□□ 2.972e-7■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 232.41■■■□□ 2.782e-7■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.022e-7■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.662e-7■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.562e-7■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.763e-7■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 GRB10-212ENST00000439044 733 ntTSL 533.84■■■■□ 3.012e-7■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.442e-7■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.272e-7■■■■□ 25
DROSHAQ9NRR4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.012e-6■■■■□ 24.9
DROSHAQ9NRR4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.562e-6■■■■□ 24.9
DROSHAQ9NRR4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.212e-6■■■■□ 24.9
DROSHAQ9NRR4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.142e-6■■■■□ 24.9
DROSHAQ9NRR4 NUDT16L1-205ENST00000590460 709 ntTSL 328.16■■■□□ 2.12e-6■■■■□ 24.9
DROSHAQ9NRR4 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 329.33■■■□□ 2.298e-9■■■■□ 24.9
DROSHAQ9NRR4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.352e-8■■■■□ 24.9
DROSHAQ9NRR4 C2orf72-203ENST00000477463 579 ntTSL 418.27■□□□□ 0.512e-8■■■■□ 24.9
DROSHAQ9NRR4 SEC24C-203ENST00000465076 4668 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.084e-8■■■■□ 24.9
DROSHAQ9NRR4 SEC24C-201ENST00000339365 4513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.134e-8■■■■□ 24.9
DROSHAQ9NRR4 SEC24C-202ENST00000345254 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-8■■■■□ 24.9
DROSHAQ9NRR4 ANKRD10-210ENST00000494859 705 ntTSL 545.51■■■■■ 4.882e-6■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.72e-6■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 ANKRD10-206ENST00000465753 997 ntTSL 1 (best)30.12■■■□□ 2.412e-6■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.822e-6■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 ANKRD10-203ENST00000460846 535 ntTSL 320.27■□□□□ 0.842e-6■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.78■■■■■ 5.728e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.98e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.498e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1E-208ENST00000431611 814 ntTSL 523.79■■□□□ 1.48e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1E-209ENST00000431632 763 ntTSL 221.86■■□□□ 1.098e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.888e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1E-213ENST00000495232 669 ntTSL 218.42■□□□□ 0.548e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1E-202ENST00000366216 1005 ntTSL 217.66■□□□□ 0.428e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.393e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.083e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.043e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.033e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.053e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 324.52■■□□□ 1.524e-26■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.614e-26■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.114e-26■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.024e-26■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.714e-26■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.794e-26■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CDK19-207ENST00000468997 1083 ntTSL 1 (best)22.49■■□□□ 1.194e-11■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CDK19-204ENST00000457688 955 ntTSL 516.44■□□□□ 0.224e-11■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.186e-8■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CATSPERE-205ENST00000460986 725 ntTSL 336.11■■■■□ 3.376e-7■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CATSPERE-208ENST00000478554 584 ntTSL 330.88■■■□□ 2.536e-7■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CATSPERE-206ENST00000464170 762 ntTSL 322.37■■□□□ 1.176e-7■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.986e-7■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.886e-7■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.76e-7■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CATSPERE-204ENST00000428042 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.02■□□□□ 0.486e-7■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 CATSPERE-207ENST00000473875 2298 ntTSL 21.93□□□□□ -2.16e-7■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 AHCYL1-205ENST00000475081 795 ntTSL 533.44■■■□□ 2.944e-9■■■■□ 24.8
DROSHAQ9NRR4 C22orf34-206ENST00000444628 453 ntTSL 517.38■□□□□ 0.371e-7■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.78■□□□□ 0.283e-8■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TOLLIP-206ENST00000527746 590 ntTSL 233.23■■■□□ 2.911e-6■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TOLLIP-205ENST00000527638 561 ntTSL 430.87■■■□□ 2.531e-6■■■■□ 24.7
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