Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2B1Q9NRF2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms