Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms