Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO6Q9NRD1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms