Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
OTORQ9NRC9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTORQ9NRC9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms