Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN5Q9NRC6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN5Q9NRC6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN5Q9NRC6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN5Q9NRC6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN5Q9NRC6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN5Q9NRC6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN5Q9NRC6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN5Q9NRC6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms