Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHST12Q9NRB3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST12Q9NRB3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms