Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM10Q9NQV6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM10Q9NQV6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms