Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms