Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNK9Q9NPC2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms