Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZCCHC17Q9NP64 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms