Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms