Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA1Q9NP55 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms