Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCX3AQ9NNX9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCX3AQ9NNX9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms