Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-5Q9HDB9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms