Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAT1LQ9HCJ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms