Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRPV4Q9HBA0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPV4Q9HBA0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms