Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIPAS39Q9H9C1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIPAS39Q9H9C1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms