Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1BQ9H816 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1BQ9H816 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms