Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAS3Q9H6U6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAS3Q9H6U6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms