Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC4Q9H6D8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms