Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH6AQ9H0K4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RSPH6AQ9H0K4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH6AQ9H0K4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.3 ms