Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC113Q9H0I3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC113Q9H0I3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms