Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
POLR2J2Q9GZM3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2J2Q9GZM3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms