Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL4Q9C0H6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.5 ms