Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZC3H12CQ9C0D7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZC3H12CQ9C0D7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms